Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TOP3AQ13472 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TOP3AQ13472 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TOP3AQ13472 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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TOP3AQ13472 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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TOP3AQ13472 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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TOP3AQ13472 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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TOP3AQ13472 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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TOP3AQ13472 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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