Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
UBE2V1Q13404 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms