Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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NR1H3Q13133 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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NR1H3Q13133 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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