Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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