Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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