Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms