Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOBRQ0VD83 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms