Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IFFO1Q0D2I5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms