Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM27E3Q08E93 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms