Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms