Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SCN1BQ07699 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SCN1BQ07699 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SCN1BQ07699 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SCN1BQ07699 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SCN1BQ07699 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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