Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSME1Q06323 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms