Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms