Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms