Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms