Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPCQ03188 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms