Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MC1RQ01726 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms