Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN7AQ01118 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN7AQ01118 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN7AQ01118 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN7AQ01118 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN7AQ01118 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN7AQ01118 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN7AQ01118 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN7AQ01118 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN7AQ01118 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN7AQ01118 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SCN7AQ01118 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCN7AQ01118 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms