Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms