Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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