Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HBBP68871 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HBBP68871 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms