Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
RPS29P62273 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
RPS29P62273 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
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