Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
EEFSECP57772 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms