Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2A2P52657 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms