Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNQ1P51787 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms