Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms