Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA2P51531 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA2P51531 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms