Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRE11P49959 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRE11P49959 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRE11P49959 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRE11P49959 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRE11P49959 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRE11P49959 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRE11P49959 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms