Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLK1P49759 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLK1P49759 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms