Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms