Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANGAP1P46060 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms