Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDF5P43026 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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