Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms