Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB2P29033 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB2P29033 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB2P29033 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB2P29033 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB2P29033 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB2P29033 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB2P29033 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB2P29033 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB2P29033 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB2P29033 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB2P29033 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB2P29033 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB2P29033 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB2P29033 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB2P29033 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB2P29033 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB2P29033 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB2P29033 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB2P29033 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB2P29033 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB2P29033 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB2P29033 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB2P29033 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB2P29033 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB2P29033 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB2P29033 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB2P29033 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB2P29033 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB2P29033 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB2P29033 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB2P29033 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB2P29033 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB2P29033 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJB2P29033 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms