Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MATN1P21941 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MATN1P21941 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MATN1P21941 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MATN1P21941 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MATN1P21941 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MATN1P21941 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MATN1P21941 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MATN1P21941 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MATN1P21941 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MATN1P21941 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MATN1P21941 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MATN1P21941 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MATN1P21941 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MATN1P21941 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MATN1P21941 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MATN1P21941 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MATN1P21941 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MATN1P21941 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MATN1P21941 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MATN1P21941 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms