Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BGNP21810 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BGNP21810 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BGNP21810 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BGNP21810 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BGNP21810 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BGNP21810 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BGNP21810 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BGNP21810 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BGNP21810 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BGNP21810 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BGNP21810 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BGNP21810 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BGNP21810 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BGNP21810 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BGNP21810 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BGNP21810 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BGNP21810 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BGNP21810 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BGNP21810 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms