Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms