Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms