Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFTRP13569 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFTRP13569 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFTRP13569 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFTRP13569 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFTRP13569 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFTRP13569 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFTRP13569 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms