Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms