Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJB1P08034 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB1P08034 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB1P08034 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB1P08034 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB1P08034 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB1P08034 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB1P08034 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB1P08034 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB1P08034 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB1P08034 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJB1P08034 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB1P08034 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB1P08034 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB1P08034 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB1P08034 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB1P08034 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB1P08034 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJB1P08034 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJB1P08034 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJB1P08034 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms