Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSLP07711 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSLP07711 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSLP07711 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms