Protein–RNA interactions for Protein: O75976

CPD, Carboxypeptidase D, humanhuman

Predictions only

Length 1,380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPDO75976 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPDO75976 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CPDO75976 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CPDO75976 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CPDO75976 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CPDO75976 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPDO75976 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPDO75976 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CPDO75976 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CPDO75976 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CPDO75976 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPDO75976 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPDO75976 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPDO75976 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPDO75976 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPDO75976 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPDO75976 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CPDO75976 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPDO75976 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPDO75976 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPDO75976 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPDO75976 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPDO75976 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPDO75976 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPDO75976 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPDO75976 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPDO75976 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms