Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMPRSS11DO60235 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms