Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCO2O43819 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCO2O43819 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCO2O43819 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCO2O43819 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCO2O43819 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCO2O43819 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCO2O43819 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCO2O43819 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms