Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms