Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2F3O00716 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F3O00716 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms