Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms