Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E9PBE3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E9PBE3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E9PBE3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E9PBE3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms