Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP73A6NFT4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms